Exposés

2012

  • String inference from integer arrays

    Arnaud Lefebvre

    I3S Seminar , Université de Nice – Sophia-Antipolis, France, February 2012

  • 2001-2010: Ten Years of Exact String Matching Algorithms

    Simone Faro and T. Lecroq

    London Stringology Days / London Algorithmic Workshop 2012, LSD and LAW 2012, London, UK, February 2012

    Talk given by T. Lecroq

2011

  • 2001-2010: Ten Years of Exact String Matching Algorithms

    Simone Faro and T. Lecroq

    SeqBio 2011: Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, Lille, France, December 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • Spell-checking queries by combining Levenshtein and Stoilos distances

    Zied Moalla, Lina Soualmia, Élise Prieur-Gaston, Thierry Lecroq and Stefan Darmoni

    NETTAB 2011, Pavia, Italy, October 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • EVA: Exome Variation Analyzer, a convivial tool for filtering strategies

    Sophie Coutant, Arnaud Lefebvre, Martine Léonard, Élise Prieur-Gaston, Dominique Campion, Thierry Lecroq, and Hélène Dauchel

    NETTAB 2011, Pavia, Italy, October 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • 2001-2010: Ten Years of Exact String Matching Algorithms

    Simone Faro and Thierry Lecroq

    Prague Stringology Conference, Prague, Tcheque Republic, August 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • Computing Abelian periods in words

    Gabriele Fici, Thierry Lecroq, Arnaud Lefebvre and Élise Prieur-Gaston

    Séminaire MaMuX IRCAM Paris 20 mai 2011

    Talk given by A. Lefebvre

  • An Efficient Motif Search Algorithm based on a minimal Forbidden Patterns Approach

    Tarek El Falah, Thierry Lecroq, and Mourad Elloumi

    Séminaire MaMuX IRCAM Paris 20 mai 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • An Efficient Motif Search Algorithm based on a Minimal Forbidden Patterns Approach

    Tarek El Falah, Thierry Lecroq, and Mourad Elloumi

    5th International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics, Salamanca (Spain),
    7th April, 2011

    Talk given by T. El-Falah

  • Des mots et des tableaux – Mais à qui est ce tableau ?

    Arnaud Lefebvre

    École Jeunes Chercheurs en Informatique Mathématique 31 mars 2011 à Amiens

  • Exome Variations Analyzer

    Sophie Coutant

    Bioinformatics and High Throughput Sequencing – 2011, 22 mars 2011, Institut Pasteur, Paris

  • Développement de l’outil bioinformatique EVA (Exome Variation Analyzer) pour l’aide à l’interpr&eaute;tation des données de séquençage haut débit

    Sophie Coutant

    Atelier du réseau des laboratoires de diagnostic moléculaire des maladies gén´tiques neurologiques, musculaires, neurosensorielles et retards mentaux, Cochin, Paris, 18 mars 2011

  • Computing Abelian Periods

    Gabriele Fici, Thierry Lecroq, Arnaud Lefebvre and Elise Prieur-Gaston

    London Stringology Days / London Algorithmic Workshop 2011 LSD & LAW 2011 February 8 2011

    Talk given by T. Lecroq

  • Computing Abelian Periods in Words

    Gabriele Fici, Thierry Lecroq, Arnaud Lefebvre and Elise Prieur-Gaston

    Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique Rennes, 10 janvier 2011

    Talk given by G. Fici

  • A solution to index large set of short reads slides

    Nicolas Philippe, Mikael Salson, Thierry Lecroq, Martine Léonard, Therese Commes and Eric Rivals

    Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique Rennes, 10 janvier 2011

    Talk given by M. Salson

2010

  • Indexing Structures and Next Generation Sequencing (NGS)

    Thierry Lecroq

    Communication invitéee aux Journées Montoises, Amiens, France, septembre 2010

  • Alignments in 2D and efficient pattern matching on encoded binary strings slides

    Thierry Lecroq

    Communication invitée au workshop Optimization and Learning : Theory, Algorithms and Applications, Metz, France, juin 2010

  • Counting different palindromes in a word in linear time

    Richard Groult, Élise Prieur and Gwénaël Richomme

    Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, Montepllier, France, 26 janvier 2010

    Talk given by R. Groult

  • Coût d’une mise à jour de la table des suffixes

    Martine Léonard, Laurent Mouchard and Mikaël Salson

    Workshop Algorithmique, combinatoire du texte et applications en bio-informatique, Montepllier, France, 26 janvier 2010

    Talk given by M. Salson

2009

  • [anglais] Dynamic Suffix Array with experiments and a specific emphasis on LCP arrays (M. Salson)

    Stringology Research Workshop 09
    Tel-Aviv, Israel, avril 2009

  • [français] Construction directe d’un vecteur de suffixes compact et répétitions maximales (É. Prieur)

    Séminaire de l’équipe Algo du GREYC
    Caen, France, mars 2009

  • [français] Compression et mise à jour des structures d’indexation (M. Salson)

    Séminaire de l’équipe MAB du LIRMM
    Montpellier, France, février 2009

  • [français] Applications de la transformée de Burrows-Wheeler (M. Salson)

    Journée des doctorants de l’École Doctorale SPMII
    Saint-Étienne-du-Rouvray, France, février 2009

  • [français] Mise à jour de la table des suffixes (M. Salson)

    Séminaire de l’équipe SEQUOIA du LIFL
    Lille, France, février 2009

  • [anglais] Dynamic Extended Suffix Arrays (M. Salson) transparents

    London String Days and London Algorithmics Workshop
    London, UK, février 2009

2008

  • [français] Structures d’indexation : compression et mise à jour (M. Salson)

    Séminaire de l’équipe Algo du GREYC
    Caen, France, novembre 2009

  • [français] Algorithmique du texte et nouvelles technologies de l’information (T. Lecroq) transparents

    Fête de la Science
    Saint-Étienne-du-Rouvray, France, novembre 2008

  • [anglais] Dynamic Burrows-Wheeler Transform (M. Salson) transparents

    Prague Stringology Conference
    Prague, République Tchèque, septembre 2008

  • [anglais] Efficient Variants of the Backward-Oracle-Matching Algorithm (S. Faro) transparents

    Prague Stringology Conference
    Prague, République Tchèque, septembre 2008

  • [français] Une nouvelle heuristique pour l’alignement de motifs 2D par programmation dynamique (A. Pauchet) transparents

    Journées Francophones de Planification, Décision et Apprentissage pour la conduite des systèmes
    Metz, France, juin 2008

  • [anglais] Dynamic Burrows-Wheeler Transform (M. Salson)

    Séminaire du département d’informatique du King’s College London
    London, UK, mai 2009

  • [anglais] Global and local alignements in 2D (T. Lecroq) transparents

    London String Days and London Algorithmics Workshop
    London, UK, février 2008

  • [français] Les structures d’index : les vecteurs de suffixes (É. Prieur)

    Séminaire TIBS
    Rouen, France, janvier 2008

2007

  • [anglais] Efficient validation and generation of Knuth-Morris-Pratt arrays (A. Lefebvre)

    Conference in Honor of Donald E. Knuth
    Bordeaux, France, octobre 2007

  • [français] Énumeration et caractérisation des arbres compacts des suffixes (N. Philippe) transparents

    Journées Algorithmique, combinatoire du texte et applications à la bioinformatique
    Marne-la-Vallée, France, septembre 2007

  • [français] Validation et génération de tableaux de Knuth-Morris-Pratt (T. Lecroq) transparents

    Journées Algorithmique, combinatoire du texte et applications à la bioinformatique
    Marne-la-Vallée, France, septembre 2007

  • [français] Construction directe d’un vecteur de suffixes compact (É. Prieur)

    Journée des doctorants du LITIS
    Rouen, France, mai 2007

  • [français] Algorithmes rapides pour la recherche de mot (T. Lecroq) transparents

    Séminaire Combinatoire et Algorithmes du LITIS
    Rouen, France, avril 2007

  • [français] Construction directe d’un vecteur de suffixes compact et répétitions maximales (É. Prieur)

    Séminaire au LIFL
    Lille, France, mars 2007

  • [anglais] Fast string matching algorithms (T. Lecroq) transparents

    London Algorithms Workshop
    London, UK, février 2007