WSM 2004

Second séminaire francophone du Web Sémantique Médical

le 9 mars 2004 à Rouen

organisé par le laboratoire Perception, Systèmes, Information (PSI), équipe L@STICS (Science et Technologies de l'Information et de la Communication en Santé) de l'UFR Médecine-Pharmacie de Rouen
en collaboration avec l'action spécifique du CNRS "Ingénierie des Connaissances de Santé (AS-ICS)
avec le parrainage du GdR STIC-Santé

Introduction
Thématiques
Programme
Comité de programme
Contact

Introduction

Ce séminaire fait suite à WSM 2003 organisé en février 2003 à Rennes (http://www.wsm2003.org/).

La notion de Web sémantique repose sur une description des ressources disponibles sur le Web. Les enjeux pour les secteurs de recherche du domaine biomédical sont particulièrement importants. La recherche dans ce domaine nécessite d'accéder à une multitude de bases de connaissances accessibles via le Web, mais hétérogènes dans leur structure et leur terminologie. Parmi ces ressources, citons les bases de données comme Swissprot, où les produits de gènes sont annotés par GeneOntology, les bases documentaires comme Medline ou le catalogue CISMeF, dont les articles sont indexés par MeSH. A une phase de construction de ces ressources a succédé une phase de mise à disposition sur le Web, qui a permis d'accéder rapidement et de n'importe quel point à l'information. Aujourd'hui, le problème qui est posé est celui d'un accès « intelligent » à cette information. Un accès permettant des recherches d'information plus précises, permettant des traitement plus sophistiqués. L'intérêt du Web sémantique est d'apporter suffisamment de renseignements sur les ressources (via des métadonnées), de décrire le contenu des ressources de manière à la fois formelle et signifiante (c'est le rôle des ontologies de domaine), de telle sorte que de nouvelles requêtes plus complexes puissent sélectionner de façon pertinente les informations recherchées. 

 

Thématiques

Les discussions seront organisées autour des thématiques (non exhaustives) suivantes :

- Méta-données et annotations dans le Web sémantique pour la recherche d'information. Types de méta-données. Méta-données basées sur des ontologies. Outils d'aide à l'annotation.

- Ontologies pour le Web sémantique. Formalismes de représentation : RDF(S), OWL, etc. Éditeurs d'ontologies. Terminologies et ontologies du domaine : UMLS, MeSH, SNOMED-CT, GeneOntology, GALEN, etc.

 - Méthodologies et adaptations pour leur utilisation dans le cadre du Web sémantique médical.

- Indexation multimédia : indexation des images et vidéos médicales.

- Problèmes posés par l'hétérogénéité des données : intégration de données multi-sources, entrepôts de données biomédicales sur le Web.

- Applications biomédicales : enseignement, sites grand public (consumer health), recherche biomédicale, applications de type « just-in-time » en pratique clinique, imagerie médicale, etc.

Programme

9h45-10h : Présentation de L@STICS et de ¨PSI - SJ. Darmoni, JP. Pécuchet

10h-11h30 : Première session de communication

LF. Soualmia, B. Dahamna, SJ. Darmoni. Représentation du thésaurus MeSH et de la terminologie CISMeF en OWL (Laboratoire Perceptions, Systèmes, Information, FRE 2645 CNRS, INSA & Université de Rouen.)  Diapos Résumé

Fleur Mougin, Christine Golbreich, Anita Burgun, Pierre Le Beux. Vers une génération automatique du mapping de sources biomédicales (Laboratoire d’Informatique Médicale, Faculté de Médecine, Université de Rennes 1)  Diapos Résumé

Simonet Michel, Bernhard Delphine, Diallo Gayo, Palmer Patrick, Ferriol Sylvain, Baldesare Frank, Cools Hans, Dhaen Christoffel. Enrichissement d’une ontologie multilingue à partir de textes pour le cancer du sein (Laboratoire TIMC-IMAG, Grenoble, Guy’s and St Thomas’ Hospital, London)  Diapos Résumé

Mathieu d’Aquin, Sébastien Brachais, Jean Lieber et Amedeo Napoli. Kasimir : portail sémantique pour la gestion des connaissances en cancérologie (LORIA, UMR7503, CNRS, INRIA-Lorraine, Universités de Nancy)  Diapos Résumé

11h30-11h45 : Pause

11h45-12h30 : Première table ronde

12h30-14h00 : Déjeuner

14h-15h30 : Première session de communication

Manuel Zacklad & Xavier Barbaud. Vers une application du Web Socio Sémantique pour la réalisation d’un système d’information destiné aux réseaux de santé (Laboratoire Tech-CICO - Université de Technologie de Troyes (UTT)).  Diapos Résumé

Sandra Bringay, Catherine Barry, Jean Charlet. Annotations dans le cadre du Dossier Patient Hospitalier (LaRIA, Equipe Ingénierie des connaissances, Université de Picardie Jules Vernes)  Diapos Résumé

Rose DIENG-KUNTZ, David MINIER, Frédéric CORBY, Olivier CORBY, Phuc-Hiep LUONG, Laurent ALAMARGUY. Exploitation d’ontologies pour la gestion des connaissances et le travail collaboratif dans un réseau de soin (INRIA, équipe ACACIA UR Sophia Antipolis)  Diapos Résumé

Communications courtes

Khaled KHELIF, Rose DIENG-KUNTZ. Web sémantique et mémoire d’expériences sur les biopuces (INRIA, équipe ACACIA UR Sophia Antipolis)  Diapos Résumé

Laurent Alamarguy, Rose Dieng-Kuntz. Acquisition de relations sémantiques pour un Web Biomédical (INRIA, équipe ACACIA UR Sophia Antipolis)  Diapos Résumé

15h30-15h45 : Pause

15h45-16h45 : Seconde table ronde

 

Comité de programme :

Bachimont Bruno (INA & UTC)
Burgun Anita (LIM, Rennes)
Charlet Jean (STIM/AP-HP & INSERM ERM 202, Paris)
Darmoni Stefan J. (PSI, Rouen)
Garlatti Serge (ENST-Bretagne, Brest)
Jaulent Marie-Christine (INSERM ERM 202, Paris)
Kassel Gilles (Laria, Amiens)
Laublet Philippe (LaLICC, Paris)
Reynaud Chantal (LRI & INRIA Futurs, Paris)
Soualmia Lina (PSI, Rouen)
Zacklad Manuel (UTT, Troyes)
Zücker Jean-Daniel (LIM&BIO, Bobigny)

 

Contact :

Pour tous renseignements complémentaires :

Contacter SJ. Darmoni au 02 32 88 88 29

Courriel : Stefan.Darmoni@chu-rouen.fr

Le séminaire WSM 2004 se déroulera le 9 mars à l'amphithéâtre Lecat sité au CHU de Rouen (hôpital Charles Nicolle) dans le pavillon Derocque.

Voir plans : http://www.chu-rouen.fr/images/hcnnbpetit.gif , http://www.chu-rouen.fr/images/hcn.gif .

Pour dormir la veille au soir, je suggère le Relais des Deux Rivières (Hôtel **) situé à 100 m du lieu du séminaire. Le tarif "préférentiel" est de 52,5 € pour une chambre simple, 62 € pour une double. Courriel : relais2r@wanadoo.fr

Sinon, vous avez également l'Hôtel Mercure Champ de Mars (***) situé à 500 m du lieu du séminaire.

Merci de me signaler si vous souhaitez assister au séminaire pour que je comptabilise les places pour le déjeuner... à votre charge.