GCSIS Gestion de la Connaissance et Systèmes d'Information en Santé

GCSIS un groupe de recherche de l'équipe TIBS (Traitement de l'Information en Biologie et Santé) du laboratoire  LITIS (Laboratoire Informatique, Traitement de l'Information et Systèmes) EA 4108,  Université & INSA de Rouen, Université du Havre

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Thèmes de recherche

Principales réalisations

Membres

Contrats de recherche

Prix

Publications et communications

Direction de travaux

Thèmes de recherche

• Systèmes de recherche d’information
• Extraction et Indexation automatique
• Outils R&D multi-terminologiques, en particulier serveur multi-terminologique médical & intérarabilité sémantique intra et inter-terminologique
• Critères de qualité de l’information de santé sur l’Internet
• Étude des systèmes d'information hospitaliers et de santé
• Développement d’outils fondés sur les Technologies de l’Information et de la Communications (TIC) pour assister Apprentissage Par Problèmes (APP) et Apprentissage du Raisonnement Clinique (ARC)
• Poster GCSIS

• CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones (URL : http://www.chu-rouen.fr/cismef)
• UMVF : Université Médicale Virtuelle Francophone (URL : http://www.umvf.org/) 
• Net Scoring (URL : http://www.chu-rouen.fr/netscoring)

Membres

• Françoise Charles, ingénieur d’études en organisation et en informatique, Faculté de Médecine de Rouen,
• Badisse Dahamna, ingénieur de recherche, Équipe CISMeF & Fédération de Recherche, CHU de Rouen
• Stéfan Darmoni, professeur d’informatique médicale, Faculté de Médecine de Rouen ; Équipe CISMeF & Fédération de Recherche, CHU de Rouen  ; Responsable de GCSIS 
• Jean-François Gehanno, maître de conférences & praticien hospitalier, Médecine du Travail, CHU de Rouen
• Gaétan Kerdelhué, documentaliste, Équipe CISMeF &  Bibliothèque médicale,  CHU de Rouen,
• Ivan Kergourlay, Ingénieur de recherche, Equipe CISMeF, CHU de Rouen & & Fédération de Recherche, CHU de Rouen
• Jean-Philippe Leroy, praticien hospitalier, Urgences & Maladies Infectieuses, CHU de Rouen,
• Catherine Letord, documentaliste, Équipe CISMeF &  Bibliothèque médicale,  CHU de Rouen,
• Philippe Massari, praticien hospitalier,  Unité d'informatique médicale, DESP, CHU de Rouen
• Aurélie Névéol, docteur en informatique, Équipe CISMeF ; est en postdoc à la US National Library of Medicine (NLM), et plus précisément au Lister Hill National Center for Biomedical Communications, pour un an à partir de février 2006 (renouvelé un an)
• Josette Piot, assistante-documentaliste, Équipe CISMeF &  Bibliothèque médicale,  CHU de Rouen,
• Louis Sibert, professeur associé en thérapeutique, praticien hospitalier,  Service de Chirurgie Urologique,
• Benoit Thirion, responsable de la bibliothèque médicale, Coordonnateur du projet CISMeF,
  
• Quatre doctorants (Filip-Ionut Florea, Alain Loisel, Suzanne Pereira, Tayeb Merbati) ; voir Direction de travaux

• Lina Soualmia, maître de conférences en informatique (CNU 27), Université Paris XIII; Labotaroire (LIM&Bio)   Équipe CISMeF entre 2001 et 2004; 

Contrats de recherches 

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• Programme Université Virtuelle Francophone (Agence Universitaire de la Francophonie) : CISMeF, 1998-2000.

• Projet Européen EVS-PIC European Voluntary Service  (programme Multilateral and third Countries projects, DG XXII Education) : mise en place et évaluation d'un cybercafé (Patient Internet Café) dans 11 hôpitaux en Europe, 1999-2000.

• Action Concertée Incitative Télémédecine et Technologies pour la Santé du Ministère de l’Enseignement, de la Recherche et de la Technologie (mission I3M, Imagerie, Instrumentation et Informatique Médicale), 1999-2000 
  

  • Université Médicale Virtuelle

  • Transmission des données médicales (ville/hôpital, hôpital de référence/hôpital de proximité) 

• Programme Educnet, Direction de la Technologie, Ministère de la Recherche : Doc'CISMeF, 2000-2002.

• Programme RNTS 2000 (Réseau National Technologies pour la Santé), Ministère de la Recherche et Secrétariat d'État à l'Industrie : 

  • Université Médicale Virtuelle Francophone (UMVF), 2000-2002.

  • Coordination pour la Qualité des Soins (COQUAS), 2000-2002.

• Programme E_Sante 2001 : Application de communication du dossier patient dans le cadre de réseaux ville-hôpital ou hôpital-hôpital
  

• Bourse de recherche industrielle pour Mlle Lina SOUALMIA (thèse d’informatique) 2001-2004.

• Safer Internet Action Plan et l’action Filtering & Rating Systems, 5^ème programme cadre de recherche et développement : Projet Européen MedCIRCLE (Collaboration for Internet Rating, Certification, Labeling and Evaluation of Health Information), 2002-2003 (URL : http://www.medcircle.org/)

• Action Concertée Incitative Bio-ingénierie pour la santé - Technologies pour la santé, Ministère de la recherche : Projet UMLF (Construction d'un lexique médical francophone unifié), 2002-2003.

• Programme RNTS 2002 " Bio-ingénierie pour la Santé ", Ministère de la Recherche et Secrétariat d'Etat à l'Industrie : Université Médicale Virtuelle Francophone 2 (UMVF), 2002-2004.

• ANAES : Évaluation de Doc’CISMeF, outil de recherche sur l'Internet pour diffuser auprès des professionnels de santé des recommandations pour la bonne pratique clinique et des conférences de consensus, 2002-2003.

• Bourse de recherche ACI UMLF pour Mlle Aurélie Névéol (thèse d’informatique) 2002-2005.
  
• Programme RNTS 2003 : VUMeF (Vocabulaire Unifié Médical Français), 2003-2005.
  
• Bourse de recherche régionale pour  M. Filip-Ionut Florea (thèse d’informatique) 2003-2006.
  
• Crédits pédagogiques de l'Association Française d'Urologie : Élaboration d’un site Internet d’évaluation du raisonnement clinique en urologie par le Test de Concordance de Script, 2004.
• Appel à propositions : " Technologies de la Langue " (Technolangue) - Volet " Evaluation " - EVALDA Constitution d’une infrastructure d’évaluation pérenne et comme sous projet EQueR : campagne sur l’évaluation des questions-réponses, 2002-2003 : rapport final
  
  Technolangue-RNTL: ATONANT - projet de construction d'ontologie à partir du corpus de documents de CISMeF. 2003.

• PI — TCAN, Programme interdisciplinaire "Traitement des connaissances, apprentissage et NTIC"Cogni-CISMeF : Étude des processus cognitifs lors de la construction d’une requête dans un système de gestion des connaissances médicales (CISMeF). , 2004-2006.

• Validation des dimensions et des composantes du niveau de preuve, dans le domaine de l'efficacité des thérapeutiques : approche par modélisation et simulation des estimations de l'efficacité des thérapeutiques. Caisse Nationale d'Assurance Maladies, 2004-2005.
  
  Appel à propositions : " Technologies de la Langue " (Technolangue) - Volet " Evaluation ". CESART : Evaluation de terminologie et de relations sémantiques extraites par les outils testés dans le cadre du ce projet, 2005
  
  Programme RNTS 2005 : Portail Institutionnel du Handicap (PIH), 2006-2007
  
  Programme RNTL 2005 : VODeL, 2006-2007 (Présentation)
  
  Bourse CIFRE pour  M. Suzanne PEREIRA (thèse d’informatique) 2006-2009 (Société Vidal).

  Programme TecSan 2007 : INTERSTIS (Interopérabilité Sémantique des Terminologies dans les Systèmes d'Information de Santé Français) 2007-2010

  Projet Européen 7ème PCRD : PSIP (Patient Safety through Intelligent Procedures in Medication) 2007-2010

  Programme TecSan 2008 : ALADIN-DTH : Assistant de Lutte Automatisé et de Détection des Infections Nosocomiales à partir de Documents Textuels Hospitaliers

  Programme TecSan 2008 : L3IM : Langage Iconique et Interfaces Interactives en Médecine

  Rare Diseases Task Force : Grant from Sanco, European union

Valorisation  

        ANAES : projet BFES, Banque Française d'Évaluation en Santé, 2003-2005.

         Ligue Contre le Cancer : Cancer Information Service, 2004-2005. L'équipe CISMeF assure la réponse aux questions les plus complexes (centre de documentation     secondaire après celui de la Ligue).

        CNCRAL : Réseau inter-CHU d’échange et de mutualisation des informations en  Médecine du Travail des personnels des établissements de Santé : un outil d’évaluation des risques professionnels et d’aide à la mise en œuvre de leur prévention par ces établissements : veille documentaire mensuelle (2005-2007).

        INCA, Institut National du Cancer : projet KISMeF : réalisation d'un outil de recherche orienté en cancérologie (2005-2006).  

        Vidal Recos, avec la société Vidal

        Laboratoire Lilly

  Prix

• Label "Expérimentation d'Intérêt Public" par le Comité Interministériel des Autoroutes et Services de l'Information (Ministère de l’Industrie) : CISMeF, 1998.
  
  
• Stéfan Darmoni et Benoit Thirion, coordinateurs du projet CISMeF, ont obtenu pour ce travail le titre de Lauréats de l'Académie nationale de médecine par l'attribution du prix Albert Sézary en octobre 2000.
  
  
• Benoit Thirion a obtenu l’Award of honour pour 2002 de European Association for Health Information and Libraries
  
  
• CISMeF a obtenu le prix des jeudis de l'ATICA aux Electrophées 2003 dans la catégorie "Réutilisation des données et XML"
  
  
• Janssen-Cilag "Future Award" (2004) for the MedCIRCLE Collaboration

Direction de Travaux

Thèse de sciences

• Lina SOUALMIA. Etude et évaluation d’une approche multiple (lexicale, sémantique et statistique) pour la projection de requêtes sur une terminologie normalisée. Thèse d’informatique, INSA  de Rouen, novembre 2001-novembre 2004. Accès au manuscrit au format pdf.

• Aurélie NEVEOL.  Développement d'un système de veille et d'indexation automatique de documents pour un catalogue de ressources de santé disponibles sur l'Internet.  Thèse d’informatique, INSA de Rouen, octobre 2002-octobre 2004.

• FLOREA Filip-Ionut. Indexation et recherche d'information combinée texte et image dans le catalogue de santé CISMeF. Thèse d’informatique, INSA de Rouen & Universté Polytechnique de Bucarest, janvier  2004-janvier  2007.  
•  
• Suzanne PEREIRA. Etude et évaluation de plusieurs méthodes d'extraction multi-terminologiques pour l'aide au codage médical (co-encadrement avec le Dr. Michel Joubert)
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1. Mastère (DEA ou DESS) de sciences

• Tayeb MERABTI. Distance inter-document. Master 2 Recherche Informatique Théorique et Applications, Université de Rouen, janvier-juillet 2007 (co-encadrement avec le Pr. T. Lecroq).

• Siwar REKIK. Modélisation de terminologies médicales. Master 2 Recherche Informatique Théorique et Applications, Université de Rouen, janvier-juillet 2007 (co-encadrement avec le Pr. T. Lecroq). 

• Suzanne PEREIRA. Etude de faisabilité de différentes méthodes d'optimisation du codage médico-économique, Master d'informatique médicale,  Paris 5, janvier-juillet 2005.

• Simon LETELLIER. Etude d'utilisabilité d'outils nomades pour accéder à une base de données médicamenteuses (Vidal® Intranet sur tablette PC et Vidal® PDA sur assistant personnel numérique). DEA d'informatique médicale. Université Paris VI, janvier-juillet 2004.

• Mihnea Hilohi. Indexation et recherche d'information combinée texte et image dans le catalogue de santé CISMeF. DEA des Sciences de l’Ingénieur, Université de Rouen, mars 2004- septembre 2004.

• Vincent GUIGUE. Développement d'un système de recherche et d'analyse automatique de documents orienté Web Sémantique pour le catalogue de santé CISMeF. DEA des Sciences de l’Ingénieur, Université de Rouen, mars 2002- septembre 2002

• Corinne Marchand. Etude des répercussions pour le CHU de Rouen de CISMeF, projet francophone ISTEM (Information Scientifique Technique et Médicale) sur l’Internet. DESS Communication et Information Scientifique Technique et Médicale, Université de Paris VII, mars 2002 - août 2002.

• P. GIBERT. Définition d'une méthode de validation pour systèmes experts. Cohérence d'une base de connaissances. DEA d'Intelligence Artificielle, Université de Caen, France, juin 1991.

Stage ingénieur

• Projet PIC pour le développement d'un serveur multi-terminologique, en collaboration avec le LERTIM de Marseille et la société MONDECA (huit étudiants à quart temps pendant huit mois) 2007.

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• Projet PIC pour le développement d'une version sécurisée d'accès au back-office de CISMeF (huit étudiants à quart temps pendant huit mois) 2006.

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• Gaëlle LOOSLI & Erwan MIRAN. Poursuite du développement de Doc'CISMeF. Une unité de valeur (5 crédits), INSA de Rouen, département Architecture des Systèmes d'Informations (ASI), septembre 2001-janvier 2002.

• Christophe GODARD & Isabelle RIGOLLE. Poursuite du développement de Doc'CISMeF. Deux unités de valeur (UV) (5 crédits), INSA de Rouen, département Architecture des Systèmes d'Informations (ASI), septembre 2000-janvier 2001 & février-juin 2001.

• Benoit LACOSTE & Stéphane VIDEAU. Développement de Doc'CISMeF, un nouvel outil de recherche fondé sur le MeSH [http://doccismef.chu-rouen.fr/]. Projet de Fin d'Etudes, INSA de Rouen, département Génie Mathématique, décembre 1999-juin 2000

• N. MAHE. Optimisation du système expert SETH. Mémoire pour l'obtention du diplôme d'Ingénieur de l'Ecole IMERIR (Institut Méditérranéen d'Intelligence Artificielle et de Robotique), octobre 1992.
  

Thèse de médecine

• L. BAERT-QUIBEL. Evaluation de l’outil de recherche Doc’CISMeF pour la diffusion des recommandations professionnelles sur l’Internet : une étude quasi-randomisée auprès des médecins généralistes. Thèse de Médecine, Faculté mixte de médecine et de pharmacie de Rouen, mai 2004 (félicitations du jury, avec échange avec l'international). Présentation de la thèse (format ppt).

• P. YAECHE. Un nouvel outil d'enseignement médical : les pages Internet de la clinique pneumologique (CHU de Rouen) (http://www.chu-rouen.fr/pneumo/pneumo0.htm). Thèse de Médecine, Faculté mixte de médecine et de pharmacie de Rouen, juin 1997.

• A. VANDOMME-TRASKA. L'apport de l'Internet dans l'exercice quotidien du médecin généraliste. Thèse de Médecine, Université Paris Sud, avril 1997 (médaille d'argent).

• N. MACHEFERT-TASSIN. Échographie anténatale des malformations de l'encéphale. Première étape d'un projet de diagnostic assisté par ordinateur des syndromes polymalformatifs. Mémoire de Diplôme d'Études Spécialisées de Radiodiagnostic et d'Imagerie Médicale, Centre Hospitalier Universitaire de Rouen, 1991.

Plan pour aboutir au CHU de Rouen

9 mars 2004 à Rouen : WSM - Second séminaire francophone du Web sémantique médical

mardi 13 octobre 2009
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