Lancement de LiSSa, base de données de la Littérature Scientifique en Santé

Depuis plus d’un an, l’équipe à l’origine de CISMeF est engagée dans un projet de construction d’une base de données bibliographiques de la littérature scientifique en Santé de langue française (voir ici et ).

Cette base de données a désormais un nom : LiSSa pour Littérature Scientifique en Santé et une adresse Web définitive www.lissa.fr.

lissa_400Cette base de données comprend aujourd’hui plus de 800 000 références issues de PubMed mais aussi de 72 journaux scientifiques qui n’y figurent pas et de 53 qui y figurent de façon incomplète. Si l’on considère uniquement les années supérieures à 2000, la moitié du contenu de LiSSa est inédite. Plus de 80 000 résumés en français sont également proposés.
La liste des périodiques apparaissant dans LiSSa est disponible à cette adresse http://www.lissa.fr/rep/revues.

Parmi les nouvelles fonctionnalités :

  • « Envoyer vers » qui permet de créer une sélection de références et de les exporter dans un format compatible avec les logiciels de gestion bibliographique (Type Zotero) ou vers un tableur (format csv).
  • Des termes MeSH ont été automatiquement assignés aux références ne provenant pas de PubMed pour faciliter leur découverte.

D’autres fonctionnalités sont prévues pour 2016 (compatibilité mobiles, alertes par e-mails, meilleur tri des résultats, liens vers CISMeF et PubMed).

LiSSa a fait l’objet d’un poster présenté à la réunion annuelle de l’ITMO Technologies pour la Santé  15/16 décembre 2015.

poster_lissa_its

Questions-Réponses sur le projet BDBfr

[Mise à jour du 09/01/2017 La nouvelle version de LiSSa, base de données des articles médicaux en français, est en ligne] [Mise à jour du 06/01/2016 : Lancement de LiSSa, base de données de la Littérature Scientifique en Santé]

Qu’est-ce que c’est ?

Il s’agit d’un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche visant à créer une base de données bibliographiques des principaux contenus scientifiques de santé en français (articles scientifiques principalement). Le projet se termine en mars 2018.

Qui participe à ce projet ?

Le CHU de Rouen mène le projet en s’appuyant sur les technologies et le savoir-faire utilisés pour réaliser CISMeF.
L’équipe Evalab du CIC-IT de Lille apporte ses méthodes de conception centrée utilisateur et son expertise en terme d’ergonomie.
La société Elsevier Masson apporte les métadonnées de ses revues scientifiques (auteurs, titres, résumés en français, liens…).
La société Alicante apporte son expertise en termes de bibliométrie et de visualisation des données bibliographiques.
La société SenseGates apporte son expertise technologique pour la recherche d’information.

Que peut-on y trouver ?

À l’heure actuelle, on y trouve des données provenant de PubMed, soit plus de 650 000 références bibliographiques provenant de plus de 2000 journaux scientifiques. Contrairement à PubMed, tout y est présenté directement en français.
Pour chaque référence, on trouve un lien vers PubMed et un lien vers la version numérique de l’article quand celui-ci existe (voir la figure ci-dessous pour les années récentes).

URLs des Articles médicaux francophones de BDBfr

Quelles sont les améliorations à venir ?

En terme de contenu, plusieurs dizaines de milliers de résumés d’articles en français provenant des revues d’Elsevier Masson, partenaire du projet, vont être affichées.

La base de données va également s’ouvrir à d’autres revues scientifiques à comité de lecture en langue française. Les revues d’Elsevier Masson seront concernées puis d’autres éditeurs seront invités à participer. 600 références de la revue Exercer sont d’ors et déjà incluses : http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&q=*exercer.fr*.ur.

En termes de fonctionnalités, nous avons notamment prévu de proposer :
– Des options de recherche plus nombreuses (par nom d’auteur, de revues etc.)
– Un meilleur tri des résultats
– La possibilité de recevoir les mises à jour par e-mail
– Une compatibilité avec les logiciels de gestion bibliographique
– Des liens pour faciliter l’obtention des articles (pour localiser les revues notamment)

Peut-on se contenter de la littérature scientifique francophone ?

Bien que la publication primaire des résultats scientifiques se fasse aujourd’hui en langue anglaise, nous pensons que la langue maternelle a un rôle important à jouer pour la formation grâce à la littérature de synthèse, dite secondaire.

BDBfr vise, par ailleurs, à faciliter le passage vers la langue anglaise en permettant l’interrogation de PubMed en français en deux clics.

Est-ce un outil utilisable durant une consultation ?

Nous souhaitons faciliter au maximum l’accès aux articles mais le temps nécessaire à l’interrogation de la base et à la lecture des articles s’accorde mieux avec une utilisation hors consultation.

Comment BDBfr se positionne-t-il par rapport au libre accès ?

Le but de cette base de données est de faciliter la découverte, l’obtention et la citation des articles scientifiques médicaux écrits en langue française, qu’ils soient gratuits ou payants.

Dès que cela est possible des liens vers les articles en texte intégral sont ajoutés. Par exemple, 1 millier de liens vers la Revue Médicale Suisse http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&wt=true&q=*revmed.ch*.ur ou 300 liens vers les archives ouvertes de HAL http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&wt=true&q=*archives-ouvertes*.ur.

Concernant la littérature grise et les ressources gratuites en général, CISMeF oeuvre depuis 20 ans à leur référencement et compte plus de 110 000 ressources aujourd’hui. Les deux bases de données, CISMeF et le prototype BDBfr, sont liées et on peut basculer de l’une à l’autre en 2 clics.

Comment BDBfr se positionne-t-il par rapport aux autres catalogues en ligne, notamment la BDSP ?

Nous pensons que BDBfr apportera une offre inédite.
Concernant la BDSP, seules 5 revues indexées « in extenso » dans cette base sont présentes également dans BDBfr (Recherche en soins infirmiers, Revue d’épidémiologie et de Santé publique, Santé Publique, Gériatrie et Psychologie Neuropsychiatrie du vieillissement, Exercer). Le chevauchement de ces deux bases est donc limité a priori.

C’est le nom définitif ?

Le premier prototype présenté lors du congrès MEDINFO 2013 (voir ici) avait pour nom MLPubMed(fr) MultiLingual PubMed French version.
BDBfr (Base de Données Bibliographiques en français) est le nom du projet financé par l’Agence National de la Recherche jusqu’à mars 2018. Le site du projet : http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/.
La base de données définitive devrait porter un autre nom mais la question n’est pas encore tranchée.

Peut-on l’utiliser dès maintenant ?

Nous avons fait le choix de rendre notre prototype publique avant que toutes les fonctionnalités soient implémentées : http://doccismef.chu-rouen.fr/bdbfr.

Pour en savoir plus sur le projet

http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/

Financement du projet BDBfr (création d’une nouvelle base de données bibliographique médicale en langue française)

L’objectif de ce projet est de mettre, gratuitement sur l’Internet, à la disposition des professionnels de santé une base de données bibliographiques en français, concernant les principaux contenus de santé présents dans les journaux scientifiques principalement, qu’ils soient en accès gratuit ou en accès payant, qu’ils proviennent de supports numériques ou de supports papier.

BDBfr proposera des services à forte valeur ajoutée, notamment autour des technologies sémantiques et de la bibliométrie. Pour cette réalisation, nous avons réuni un consortium avec deux équipes académiques spécialisées en e-santé et trois industriels (Équipe CISMeF du CHU de Rouen, Laboratoire Evalab, Elsevier-Masson, Alicante et SenseGates).

Ce projet a été sélectionné et financé par l’ANR au titre de l’appel à projets générique du Plan d’action 2014, défi « Santé et bien-être »

 

Le site décrivant le projet : http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/

Une première version de la base de données est accessible à l’adresse : http://doccismef.chu-rouen.fr/bdbfr.