Les archives francophones des bases de données Pascal et Francis dans le domaine de la Santé sont intégrées à LiSSa

Durant l’été 2017 les archives francophones des bases de données Pascal et Francis dans le domaine de la Santé ont été intégrées à LiSSa.

Un total de 476 275 références d’articles ont été intégrées dont :

  • 306 269 nouvelles références
  • 170 006 références fusionnées avec des notices existantes
  • 263 618 nouveaux résumés.

Ces références sont datées de 1946 à 2014.

Aujourd’hui LiSSa propose plus de 1,1 million de références.

L’ensemble des archives de Pascal et Francis est consultable sur le site http://pascal-francis.inist.fr/ conçu et réalisé par l’Inist-CNRS.

Retour sur le séminaire LiSSa du 27 juin

Le 27 juin dernier, un séminaire consacré à la base de données LiSSa (projet BDBfr) s’est déroulé dans les locaux du laboratoire LIMICS à Paris.
Les intervenants étaient : le Pr Darmoni, Julien Grosjean, Gaétan Kerdelhué (CHU de Rouen), Sandrine Lebastard (Cité de la Santé), le Dr Matthieu Schuers (Université de Rouen).

Vous trouverez dans le document ci-joint les diaporamas présentés ainsi qu’une transcription des présentations orales.

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La nouvelle version de LiSSa, base de données des articles médicaux en français, est en ligne

Une nouvelle version du site www.lissa.fr (Littérature Scientifique en Santé) est en ligne.

Les nouveautés sont :

  • Temps de réponses améliorés
  • Tri par pertinence
    Les revues de la littérature et les recommandations récentes sont mises en avant dans les résultats.
  • Compatibilité avec tous types d’écran (smartphone, tablette etc.)
  • Nouveau formulaire de recherche avancée
    Pour des recherches thématiques complexes ou pour chercher par noms d’auteur ou de revue. – démo

La base LiSSa  compte plus de 860 000 articles. Elle est mise à jour quotidiennement. La liste des revues qui apparaissent dans LiSSa est consultable à cette adresse : http://www.lissa.fr/rep/revues.

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Vidéos de présentation : https://www.youtube.com/playlist?list=PLtvVqqUuvjEVL-E8ATWofsk1BW57nYPHz

Fonctionnalités à venir en 2017 :

  • Liens vers CISMeF et PubMed
  • Création d’alertes
  • Cartographie des auteurs
  • Intégration d’un score bibliométrique

 

Du nouveau contenu pour LiSSa

LiSSa, base de données de la littérature scientifique en santé francophone, a été enrichie de nouveaux contenus au cours du mois de mars :

  • Ajouts de liens directs vers les archives gratuites de plusieurs revues
Histoire des Sciences médicales (1978-2014)
Le Mali médical (2006-2012)
Recherche en soins infirmiers (2005-2013)
Revue Médicale Suisse (2005-2014)
Santé publique (2001-2015)
Vesalius (1995-2005)

Ajout du 12/04/2016 Bulletin de l’Académie nationale de médecine (2001-2014)

  • Les références des traités EMC, plus de 7000, sont maintenant disponibles
EMC – Anesthésie-Réanimation
EMC – Angéiologie
EMC – Appareil locomoteur
EMC – Biologie médicale
EMC – Cardiologie
EMC – Cosmétologie et dermatologie esthétique
EMC – Dermatologie
EMC – Endocrinologie – Nutrition
EMC – Gastro-entérologie
EMC – Gynécologie
EMC – Hématologie
EMC – Hépatologie
EMC – Kinésithérapie – Médecine physique – Réadaptation
EMC – Maladies infectieuses
EMC – Médecine buccale
EMC – Médecine d’urgence
EMC – Neurologie
EMC – Néphrologie
EMC – Obstétrique
EMC – Ophtalmologie
EMC – Oto-rhino-laryngologie
EMC – Pathologie professionnelle et de l’environnement
EMC – Pneumologie
EMC – Podologie
EMC – Psychiatrie
EMC – Pédiatrie – Maladies infectieuses
EMC – Radiologie et imagerie médicale – Abdominale – Digestive
EMC – Radiologie et imagerie médicale – Cardiovasculaire – Thoracique – Cervicale
EMC – Radiologie et imagerie médicale – Génito-urinaire – Gynéco-obstétricale – Mammaire
EMC – Radiologie et imagerie médicale – Musculosquelettique – Neurologique – Maxillofaciale
EMC – Radiologie et imagerie médicale – Principes et techniques – Radioprotection
EMC – Savoirs et soins infirmiers
EMC – Techniques chirurgicales – Appareil digestif
EMC – Techniques chirurgicales – Chirurgie plastique reconstructrice et esthétique
EMC – Techniques chirurgicales – Chirurgie vasculaire
EMC – Techniques chirurgicales – Gynécologie
EMC – Techniques chirurgicales – Orthopédie – Traumatologie
EMC – Techniques chirurgicales – Thorax
EMC – Techniques chirurgicales – Tête et cou
EMC – Techniques chirurgicales – Urologie
EMC – Traité de médecine AKOS
EMC – Urologie
EMC – Vétérinaire

Accéder à un article avec LiSSa

Depuis la présentation de LiSSa, la base de données bibliographiques de la littérature scientifique en Santé de langue française, de nouvelles fonctionnalités ont été ajoutées.

Lors de votre recherche, vous pouvez savoir en un coup d’œil si la référence qui vous intéresse est accessible gratuitement ou non.

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En cliquant sur le titre de l’article, vous accédez à ses références et à un lien direct.

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Si aucun lien direct n’est trouvé, plusieurs moyens de rechercher l’article vous sont proposés :

  • Un lien vers Google Scholar,
  • Le lien vers la page d’accueil de la revue,
  • Des liens pour trouver les bibliothèques abonnées via Sudoc pour la France et WorldCat pour l’international.

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Il est possible d’utiliser un résolveur de liens sur LiSSa avec le logiciel Zotero en suivant la démarche décrite ici https://www.zotero.org/support/fr/locate.

Lancement de LiSSa, base de données de la Littérature Scientifique en Santé

Depuis plus d’un an, l’équipe à l’origine de CISMeF est engagée dans un projet de construction d’une base de données bibliographiques de la littérature scientifique en Santé de langue française (voir ici et ).

Cette base de données a désormais un nom : LiSSa pour Littérature Scientifique en Santé et une adresse Web définitive www.lissa.fr.

lissa_400Cette base de données comprend aujourd’hui plus de 800 000 références issues de PubMed mais aussi de 72 journaux scientifiques qui n’y figurent pas et de 53 qui y figurent de façon incomplète. Si l’on considère uniquement les années supérieures à 2000, la moitié du contenu de LiSSa est inédite. Plus de 80 000 résumés en français sont également proposés.
La liste des périodiques apparaissant dans LiSSa est disponible à cette adresse http://www.lissa.fr/rep/revues.

Parmi les nouvelles fonctionnalités :

  • « Envoyer vers » qui permet de créer une sélection de références et de les exporter dans un format compatible avec les logiciels de gestion bibliographique (Type Zotero) ou vers un tableur (format csv).
  • Des termes MeSH ont été automatiquement assignés aux références ne provenant pas de PubMed pour faciliter leur découverte.

D’autres fonctionnalités sont prévues pour 2016 (compatibilité mobiles, alertes par e-mails, meilleur tri des résultats, liens vers CISMeF et PubMed).

LiSSa a fait l’objet d’un poster présenté à la réunion annuelle de l’ITMO Technologies pour la Santé  15/16 décembre 2015.

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Questions-Réponses sur le projet BDBfr

[Mise à jour du 09/01/2017 La nouvelle version de LiSSa, base de données des articles médicaux en français, est en ligne] [Mise à jour du 06/01/2016 : Lancement de LiSSa, base de données de la Littérature Scientifique en Santé]

Qu’est-ce que c’est ?

Il s’agit d’un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche visant à créer une base de données bibliographiques des principaux contenus scientifiques de santé en français (articles scientifiques principalement). Le projet se termine en mars 2018.

Qui participe à ce projet ?

Le CHU de Rouen mène le projet en s’appuyant sur les technologies et le savoir-faire utilisés pour réaliser CISMeF.
L’équipe Evalab du CIC-IT de Lille apporte ses méthodes de conception centrée utilisateur et son expertise en terme d’ergonomie.
La société Elsevier Masson apporte les métadonnées de ses revues scientifiques (auteurs, titres, résumés en français, liens…).
La société Alicante apporte son expertise en termes de bibliométrie et de visualisation des données bibliographiques.
La société SenseGates apporte son expertise technologique pour la recherche d’information.

Que peut-on y trouver ?

À l’heure actuelle, on y trouve des données provenant de PubMed, soit plus de 650 000 références bibliographiques provenant de plus de 2000 journaux scientifiques. Contrairement à PubMed, tout y est présenté directement en français.
Pour chaque référence, on trouve un lien vers PubMed et un lien vers la version numérique de l’article quand celui-ci existe (voir la figure ci-dessous pour les années récentes).

URLs des Articles médicaux francophones de BDBfr

Quelles sont les améliorations à venir ?

En terme de contenu, plusieurs dizaines de milliers de résumés d’articles en français provenant des revues d’Elsevier Masson, partenaire du projet, vont être affichées.

La base de données va également s’ouvrir à d’autres revues scientifiques à comité de lecture en langue française. Les revues d’Elsevier Masson seront concernées puis d’autres éditeurs seront invités à participer. 600 références de la revue Exercer sont d’ors et déjà incluses : http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&q=*exercer.fr*.ur.

En termes de fonctionnalités, nous avons notamment prévu de proposer :
– Des options de recherche plus nombreuses (par nom d’auteur, de revues etc.)
– Un meilleur tri des résultats
– La possibilité de recevoir les mises à jour par e-mail
– Une compatibilité avec les logiciels de gestion bibliographique
– Des liens pour faciliter l’obtention des articles (pour localiser les revues notamment)

Peut-on se contenter de la littérature scientifique francophone ?

Bien que la publication primaire des résultats scientifiques se fasse aujourd’hui en langue anglaise, nous pensons que la langue maternelle a un rôle important à jouer pour la formation grâce à la littérature de synthèse, dite secondaire.

BDBfr vise, par ailleurs, à faciliter le passage vers la langue anglaise en permettant l’interrogation de PubMed en français en deux clics.

Est-ce un outil utilisable durant une consultation ?

Nous souhaitons faciliter au maximum l’accès aux articles mais le temps nécessaire à l’interrogation de la base et à la lecture des articles s’accorde mieux avec une utilisation hors consultation.

Comment BDBfr se positionne-t-il par rapport au libre accès ?

Le but de cette base de données est de faciliter la découverte, l’obtention et la citation des articles scientifiques médicaux écrits en langue française, qu’ils soient gratuits ou payants.

Dès que cela est possible des liens vers les articles en texte intégral sont ajoutés. Par exemple, 1 millier de liens vers la Revue Médicale Suisse http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&wt=true&q=*revmed.ch*.ur ou 300 liens vers les archives ouvertes de HAL http://doccismef.chu-rouen.fr/dc/#env=bdbfr&wt=true&q=*archives-ouvertes*.ur.

Concernant la littérature grise et les ressources gratuites en général, CISMeF oeuvre depuis 20 ans à leur référencement et compte plus de 110 000 ressources aujourd’hui. Les deux bases de données, CISMeF et le prototype BDBfr, sont liées et on peut basculer de l’une à l’autre en 2 clics.

Comment BDBfr se positionne-t-il par rapport aux autres catalogues en ligne, notamment la BDSP ?

Nous pensons que BDBfr apportera une offre inédite.
Concernant la BDSP, seules 5 revues indexées « in extenso » dans cette base sont présentes également dans BDBfr (Recherche en soins infirmiers, Revue d’épidémiologie et de Santé publique, Santé Publique, Gériatrie et Psychologie Neuropsychiatrie du vieillissement, Exercer). Le chevauchement de ces deux bases est donc limité a priori.

C’est le nom définitif ?

Le premier prototype présenté lors du congrès MEDINFO 2013 (voir ici) avait pour nom MLPubMed(fr) MultiLingual PubMed French version.
BDBfr (Base de Données Bibliographiques en français) est le nom du projet financé par l’Agence National de la Recherche jusqu’à mars 2018. Le site du projet : http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/.
La base de données définitive devrait porter un autre nom mais la question n’est pas encore tranchée.

Peut-on l’utiliser dès maintenant ?

Nous avons fait le choix de rendre notre prototype publique avant que toutes les fonctionnalités soient implémentées : http://doccismef.chu-rouen.fr/bdbfr.

Pour en savoir plus sur le projet

http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/

Financement du projet BDBfr (création d’une nouvelle base de données bibliographique médicale en langue française)

L’objectif de ce projet est de mettre, gratuitement sur l’Internet, à la disposition des professionnels de santé une base de données bibliographiques en français, concernant les principaux contenus de santé présents dans les journaux scientifiques principalement, qu’ils soient en accès gratuit ou en accès payant, qu’ils proviennent de supports numériques ou de supports papier.

BDBfr proposera des services à forte valeur ajoutée, notamment autour des technologies sémantiques et de la bibliométrie. Pour cette réalisation, nous avons réuni un consortium avec deux équipes académiques spécialisées en e-santé et trois industriels (Équipe CISMeF du CHU de Rouen, Laboratoire Evalab, Elsevier-Masson, Alicante et SenseGates).

Ce projet a été sélectionné et financé par l’ANR au titre de l’appel à projets générique du Plan d’action 2014, défi « Santé et bien-être »

 

Le site décrivant le projet : http://www.chu-rouen.fr/bdbfr/

Une première version de la base de données est accessible à l’adresse : http://doccismef.chu-rouen.fr/bdbfr.