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 25 août 2009

remarques au :
maitre-toile.cismef@chu-rouen.fr

 

Aide à la recherche

 

 

L'outil de recherche Doc'CISMeF

http://doccismef.chu-rouen.fr/

CISMeF est organisé notamment à l'aide d'un thesaurus, le "MeSH". Utiliser le (ou les) bon(s) mot(s) clé(s) améliore considérablement les recherches.

Pour trouver un mot clé, vous pouvez utiliser notre outil de Terminologie.

 

 

La recherche simple

(Rubrique en cours de mise à jour)
Voir les nouveautés :
http://www.cismef.org/blog/?p=209

 

Ce type de recherche peut s'effectuer sur un seul et unique mot ou sur une expression.

La recherche peut s'effectuer en langage naturel ou à l'aide de termes de notre terminologie.

 

Lorsqu'on lance une recherche simple, Doc'CISMeF effectue plusieurs opérations :

 

1) La phonémisation.
Les mots saisis sont interprétés phonétiquement. Cette opération permet la gestion du singulier et du pluriel et éventuellement la correction de fautes d'orthographe.

Exemple : maladi d'alzaîmer.

 

2) La recherche dans notre terminologie et dans le titre des ressources.
Les mots saisis sont comparés avec notre terminologie et les ressources. Si le mot (ou l'expression) correspond à un
terme réservé ou appartient au titre de la ressources alors toutes les notices correspondantes sont affichées (avec explosion des résultats).

 

3) La recherche au sein de la notice.
Si l'expression saisie ne correspond pas aux termes réservés ou aux titres alors, elle est recherchée au sein de la notice, dans l'ensemble des
champs.

Exemples : histo-immunologie

 

4) La recherche en texte intégral

En dernier lieu, le mot, ou l'expression, est recherché au sein du texte lui-même.

Exemple : Asthme chronique modéré.

 

- Interprétation de la requête : des étoiles indiquent le degré d'adéquation de la requête formulée avec la terminologie CISMeF.

Score Interprétation de la requête
requête composée de mots réservés et de mots présents dans le titre de certaines ressources
requête composée de mots réservés et/ou de mots présents (et proches les uns des autres) dans la description de certaines ressources
requête composée de mots présents (et proches les uns des autres) dans le contenu de certaines ressources

 

 

- Si aucune réponse n'est trouvée, vous obtiendrez ce message :


0 ressource trouvée. L'expression '     ' ne fournit pas de résultat dans Doc'CISMeF


Essayez une recherche avec de nouveaux termes ou tournez-vous vers notre terminologie pour trouver les bons mots clés.

 

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La recherche avancée

(Rubrique en cours de mise à jour)
Voir les nouveautés :
http://www.cismef.org/blog/?p=209 
et des exemples
http://www.cismef.org/blog/?p=213

 

Ce mode de recherche permet d'effectuer des recherches précises, sur tous les champs, à l'aide ou non des opérateurs booléens ET, OU, SAUF.

 

 

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Voir également les conseils pratiques.

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Codes et opérateurs booléens

 

             

1) Généralités

 

Ce mode de recherche est destiné aux personnes sachant utiliser les opérateurs booléens. Ces codes et opérateurs peuvent être utilisés à partir de la Recherche simple.

Les requêtes s'écrivent "manuellement".

Les opérateurs booléens peuvent s'écrire en français (ET, OU, SAUF) ou en anglais (AND, OR, NOT), en majuscules ou en minuscules.

A chaque champ correspond un code (du type "ti" pour le champ "titre" par exemple). Voir la liste complète des codes. Ce code doit être affilié à un contenu en séparant les deux éléments par un point.

Exemple : on recherche des textes contenant "santé sanitaire" dans le titre.

 

la saisie correspondant à la requête sera : 

santé sanitaire.ti ET texte.tr
tr est le code correspondant au type de ressource

 

  • Utilisation des parenthèses

Il est possible d'utiliser des parenthèses, comme dans l'exemple suivant :

(cholestérol.mc OU hypercholestérolémie.mc) ET 2000.an

Cette requête permet d'obtenir les ressources indexées avec le mot clé cholestérol ou  hypercholestérolémie et datant de l'année 2000.

 

  • Utilisation de la pondération et de l'explosion

On peut préciser la pondération d'un terme de recherche avec le code [majeur]

Exemples

grossesse.mc[majeur]

microscopie.tr[majeur]

L'explosion des termes s'effectue par défaut, pour l'empêcher on peut utiliser le code [nonexpl].

Exemple :

tabagisme.mc[nonexpl]

Les deux codes peuvent s'utiliser conjointement.

Exemple :

maladies transmissibles.mc[majeur][nonexpl]

A utiliser avec précaution, vous risquez de perdre des références pertinentes en utilisant ces codes.

  • Utilisation de la troncature

Il est possible d'inclure une troncature (remplaçant une ou plusieurs lettres) au début, à la fin ou au milieu d'un mot, en utilisant le signe *.

exemples :

 

sang*.mc inclut les termes sang, cellule sanguine et sang, maladie

*rétine.mc inclut les termes dégénérescence rétine et décollement rétine

an*ie.mc inclut les termes anémie, anatomie, etc...

 

Lorsque la troncature s'effectue sur une seule lettre, il est possible d'utiliser le caractère ?

 

exemple :

 

an?mie.mc

 

Il est aussi possible d'associer les deux, comme par exemple : an?m*.mc

 

Vous pouvez consulter la rubrique Exemples pour voir des utilisations concrètes de la recherche booléenne.

 

2) La recherche booléenne et la recherche d’informations sur les substances (chimiques, biologiques)

 

Depuis peu, la terminologie « CISMeF » s’est enrichie d’environ 170 000 supplementary concept records (sc) fournis par le MeSH.
Ces sc correspondent globalement à des substances « chimiques » (médicaments, produits toxiques, mais aussi certaines enzymes …), pour lesquelles il n’existe pas de mot-clé MeSH.
Les « sc » sont considérés comme des termes MeSH, mais ne sont pas hiérarchisés.
De façon générale, dans le MeSH, une substance chimique peut correspondre à un mot-clé ou à un supplementary concept.
La recherche booléenne s’est adaptée en conséquence et permet désormais d’effectuer des recherches sur une substance correspondant à un mc ou un sc :

             - par son nom (ou synonymes)

            - par son numéro CAS (Chemical Abstract Service)

En ce qui concerne plus spécifiquement les médicaments, il est aussi possible d’effectuer des recherches :

            - par le nom commercial (nom de la spécialité)

            - par le nom de son principe actif (nom de la substance)

            - par la codification ATC (Anatomique, Thérapeutique, Chimique)

            - ou encore sur une classe pharmacologique

 

  •  De nouveaux codes champs spécifiques du médicament ont été créés :

 ap = actions pharmacologiques
 ca = codification ATC
 
nc = nom commercial
 sb = substances
 
sc = supplementary concept records

a) ap : actions pharmacologiques

La limitation à ce champ permet d’effectuer une recherche sur l’ensemble des substances possédant cette action pharmacologique. En effet, le concept d’ « actions pharmacologiques » permet de regrouper les substances (mots-clés et/ou supplementary concept) ayant une action pharmacologique commune.

Exemple : l'action pharmacologique "antianémiques"

Antianémiques.ap <=> acide folique.sb ou composés du fer III.sb ou époétine alfa.sb ou extraits hépatiques.sb ou hydroxocobalamine.sb ou darbepoetin alfa.sb ou ferric gluconate.sb ou ferric oxide, saccharated.sb ou ferrous gluconate.sb ou hexamethylene bisacetamide.sb ou iron protein succinylate.sb ou teferrol.sb

Pour connaître la liste des substances reliées à une action pharmacologique, il faut consulter le serveur de Terminologie en limitant la recherche aux actions pharmacologiques:

 

b) ca :codification ATC (Classification Anatomique, Thérapeutique et Chimique)

La limitation à ce champ permet d’effectuer une recherche sur le code ATC ou sur le libellé ATC.

exemples :

N07BA01.ca
Gaz médicaux.ca

c) nc : nom commercial

Le nom commercial correspond au nom de la spécialité médicamenteuse.

La limitation à ce champ permet d’effectuer une recherche sur le nom commercial de cette spécialité, sur son code CIS (Code d’Identification de la Spécialité), ou sur son code CIP (Code d’Identification de la Présentation)

Exemples :

doliprane.nc (recherche sur le nom commercial "Doliprane")
3295935.nc  (recherche sur le code CIP de ADVIL 200 MG -  20 Comprimes enrobés )

d) sb : substances

Lorsqu’une substance correspond à un terme MeSH, la limitation à ce champ permet d’effectuer des recherches sur le nom de la substance (du principe actif s’il s’agit d’un médicament), ses synonymes éventuels et sur son numéro CAS (qui correspond au champ «Registry Number » dans le MeSH Browser). 

Exemples :

piroxicam.sb   (recherche sur le nom de substance "piroxicam" <=> piroxicam.mc[nonexpl])
tenoxicam.sb  (recherche sur le nom de substance "tenoxicam") <=> tenoxicam.sc
59-30-3.sb      (recherche sur le numéro CAS de l'acide folique)

e) sc : supplementary concept records

La limitation à ce champ permet d’effectuer une recherche sur le nom d’une substance qui correspond à un supplementary concept, ses synonymes, ou sur son numéro CAS.

Exemples :

amprenavir.sc
161814-49-9.sc   (recherche sur le numéro CAS de l'amprenavir)

 

  • De nouveaux types de ressources liés aux médicaments ont été créés

 
Les types de ressources liés aux médicaments sont regroupés sous le type générique « information sur le médicament » selon cette hiérarchie :

 information sur le médicament
            avis de vigilance sanitaire
            évaluation médicament
                        avis de la commission de transparence
            monographie pharmacie
            notice médicamenteuse
            recommandation de bon usage du médicament
            résumé des caractéristiques du produit

Pour les produits toxiques, le type « fiche toxicologique » correspond à une synthèse des informations toxicologiques concernant un produit ou un groupe de produits :

            Fiche toxicologique 

Ces types de ressources sont exploitables en recherche booléenne selon le modèle de requête « type.tr »

Exemples :

fiche toxicoloque.tr
recommandation de bon usage du médicament.tr
résumé des caractéristiques du produit.tr

NB : ces types de ressources sont aussi proposés à partir du menu déroulant du champ « types de ressources » de la recherche avancée

  • La présentation des résultats

 La présentation des résultats pour les ressources concernant des substances chimiques est particulière. 
En plus des champs « mots-clés » et « types », un champ « substances » indique : 

- le(s) mot(s)-clé(s) ou le «supplementary concept» qui correspond à la substance mentionnée dans la ressource

- le mc qui correspond à l’action pharmacologique contextuelle (c'est-à-dire à l’action pharmacologique qui est mentionnée dans la ressource), s’il y a lieu.

- enfin, si la substance correspond à un supplementary concept, le(s) mot(s)-clé(s) vers lequel le MeSH propose un « mapping »


exemple : 

substance mentionnée sc = amprénavir (correspond au principe actif du médicament)
mapping MeSH vers les mc : carbamates ; sulfonamides
actions pharmacologiques contextuelles : agents antiVIH ; inhibiteurs de protéase du VIH

 

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L'affichage des résultats

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Les options d'affichage apparaissent lorsque l'on clique sur

 

Après une première recherche, les résultats apparaissent sous la forme d'une liste présentant les ressources sous forme résumée triées par date de publication.

Les ressources apparaissent sous la forme d'une "notice abrégée" comprenant le titre, les auteurs, le site éditeur, un descriptif du contenu, les mots clés, les qualificatifs, le type de ressources et les URLs. Il suffit de cliquer sur le titre ou sur l'une des URLs pour accéder à la ressource.

Par défaut, seuls les mots clés majeurs s'affichent. Pour voir tous les mots clés de tous les résultats, cliquer sur .

Il est néanmoins possible de choisir un autre mode d'affichage. Trois autres modes d'affichage sont possible :

  • titre uniquement
  • titre et url
  • titre, url, mots clés, qualificatifs et type de ressource

Quel que soit le mode d'affichage choisi, il est possible de cliquer sur le bouton pour obtenir toutes les informations disponibles, sous la forme d'une notice dite "complète".

Le nombre de résultats par page est également paramétrable : 10, 20 (par défaut), 50, 100 notices par page.

Les ressources sont affichables avec un tri par date de publication, par pays, par ordre alphabétique des titres ou encore par type de ressources.

 

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L'extension de recherche

 

 

A droite des résultats, une extension de recherche est désormais proposée avec :
- les mots clés MeSH correspondant aux mots recherchés ou s’en approchant
- des renvois vers les termes voisins
- les concepts associés statistiquement

Exemple : extension de la recherche Paracétamol

En cliquant sur analgésiques non stupéfiants on lance une requête sur ce terme seul.

En cochant les deux cases puis rechercher, on lance une nouvelle recherche sur l'union (OU) des deux termes.

 

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Les recherches complémentaires

 

 

Après une recherche sur Doc'CISMeF vous avez la possibilité de lancer une recherche complémentaire vers des bases de données anglophones ou une recherche avec Google (sélection CISMeF).

 

Google (sélection CISMeF)

 

Les résultats de cette recherche sont triés en fonction d'une sélection des ressources par CISMeF. Les sites sélectionnés sont identifiés par ce message "Labeled Choix CISMeF". Il s'agit des sites répondant à nos critères éditoriaux déjà présents dans le catalogue.
3 options sont proposées : Étudiants, Grand public, Professionnels de santé.
Elles modifient le tri des résultats en faveur des sites susceptibles de proposer du contenu pour ces publics.
Cette recherche Google avec sélection CISMeF est réalisée dans le cadre de
Google co-op.

 

Les bases de données proposées sont :

 

- NGC

National Guideline Clearinghouse™, base de données américaine de recommandations pour la pratique clinique.

 

- PubMed (Medline)

Base de données bibliographiques produite par la National Library of Medicine qui couvre plus de 4800 journaux en biomédecine et santé.

 

- OMNI

Organising Medical Networked Information, portail britannique de ressources de haute qualité en santé et en médecine sur Internet.

 

- NLM Gateway

Portail Internet permettant d'interroger simultanément plusieurs outils de recherche d'informations et bases de données de la NLM.

 

- Entrez

Outil permettant d'interroger simultanément l'ensemble des bases de données du National Center for Biotechnology Information.

 

- MedlinePlus

Service de la NLM regroupant par thèmes des informations de santé sélectionnées à destination du grand public.

 

Ces recherches complémentaires reposent sur la traduction automatique des descripteurs MeSH. C'est pourquoi il est nécessaire d'effectuer une requête en adéquation avec notre terminologie () pour qu'elles fonctionnent pleinement.

Les liens vers MedlinePlus et NGC sont proposés contextuellement, lorsque la requête porte sur des recommandations ou des documents destinés aux patients. 

 


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